texworks에 대해서는 모르겠습니다만, 어쨌든 xetex이 synctex 문제에 상관할 리도 없고요.

texshop이 synctex을 처리하는 데 뭔가 약간 어긋나는 게 있는 모양입니다.

더 정확한 위치를 찾아가기를 원하신다면 "Both" (즉 search 방식과 synctex을 동시에 쓰는 것)를 선택해보십시오.

(Preferences -> Typesetting -> Sync Method)